Logiciels de comptabilité en Suisse : le comparatif 2026
Onze solutions suisses, prix et fonctions côte à côte
← Retour à la vue d’ensembleLorsqu’une entreprise individuelle cherche un logiciel de comptabilité, elle compare en général deux chiffres : le prix et le nombre de fonctions. Les deux sont plus difficiles à comparer qu’il n’y paraît. Les uns facturent au mois, les autres à l’année ; les uns annoncent des prix avec la TVA, les autres sans ; et ce qui manque dans le forfait le moins cher figure rarement sur la page des tarifs.
Cette page met côte à côte onze solutions suisses envisageables pour les indépendants et les entreprises individuelles. Toutes les indications proviennent des pages de tarifs des fournisseurs eux-mêmes, vérifiées le 19 septembre 2026 – et non de portails comparatifs, dont les chiffres se sont révélés systématiquement périmés.
Ce que coûtent les fournisseurs par année
| Fournisseur | Prix par année | Ce qui est compris |
|---|---|---|
| CashCtrl FREE | CHF 0 | Comptabilité en partie double et factures QR, mais un seul utilisateur et pas d’import bancaire |
| Swiss21 Starter (Abacus) | CHF 0 | 1 utilisateur, 1000 documents envoyés par an, factures QR, TVA selon la méthode brute uniquement |
| Pfeffersack | CHF 60 (abonnement annuel) | Factures, gestion des clients, saisie du temps, gestion de la TVA |
| Banana Professional | CHF 89 hors TVA (CHF 96.21) | Comptabilité en partie double comme logiciel de bureau, recommandé par le fournisseur jusqu’à CHF 100’000 de chiffre d’affaires |
| Milchbüechli | CHF 96 (carte/PayPal), CHF 108 sur facture | Uniquement un compte de recettes et dépenses, sans facturation |
| Effizo | CHF 120 (pas de TVA) | Comptabilité simplifiée, factures QR avec rappels, TVA, rapprochement bancaire, utilisateurs illimités |
| Simplino | CHF 149 | Comptabilité simplifiée, factures QR, TVA |
| Banana Advanced | CHF 179 | Comme Professional, avec décompte de TVA ; recommandé dès CHF 100’000 de chiffre d’affaires |
| Swiss21 Basic (Abacus) | CHF 252 (CHF 21 par mois) | 3 utilisateurs (CHF 5 par mois par utilisateur supplémentaire), 2100 documents par an, méthode nette et taux de la dette fiscale nette |
| MILKEE Basic | CHF 298.80 hors TVA (CHF 323.00) | Jusqu’à CHF 500’000 de chiffre d’affaires, 120 scans de justificatifs par an, 2 utilisateurs |
| Magic Heidi Pro | CHF 299 (CHF 25 par mois) | Factures et dépenses pour freelances ; plan gratuit limité à 3 factures |
| CashCtrl PRO | CHF 350 | 3 utilisateurs, 2 organisations, import bancaire et téléversement des justificatifs |
| bexio Basic | CHF 420 hors TVA (CHF 454.02) | Sans connexion bancaire et sans saisie des justificatifs |
| bexio Advanced | CHF 504 hors TVA (CHF 544.82) | Avec connexion bancaire et saisie des justificatifs, conçu pour les PME avec une équipe |
| KLARA Business BASIC | dès CHF 576 (dès CHF 48 par mois) | Forfait PME, les autres modules sont facturés en plus |
Source : les pages de tarifs des fournisseurs concernés, vérifiées le 19 septembre 2026. Lorsqu’un rabais annuel existe, le prix annuel est calculé à partir du tarif mensuel réduit. La TVA n’est mentionnée que là où le fournisseur la mentionne lui-même ; chez Banana, bexio et MILKEE, elle est ajoutée entre parenthèses au taux de 8,1 %. Les prix peuvent changer – seule la liste de prix actuelle du fournisseur fait foi.
Pourquoi le prix seul ne dit pas grand-chose
La TVA est traitée différemment. bexio, Banana et MILKEE annoncent leurs prix hors TVA – CHF 420 deviennent ainsi CHF 454.02. Pour une entreprise individuelle réalisant moins de CHF 100’000 de chiffre d’affaires et qui n’est donc pas assujettie, ce n’est pas un poste récupérable, mais une charge réelle. Sur le prix d’Effizo, aucune TVA ne s’ajoute : CHF 120 restent CHF 120.
Gratuit est rarement assez gratuit. CashCtrl FREE tient une comptabilité en partie double complète, mais ne permet ni de téléverser des justificatifs ni d’importer des mouvements bancaires – les deux ne figurent que dans le plan à CHF 350. Chez Swiss21, le forfait Starter est gratuit, mais il ne couvre qu’un utilisateur et 1000 documents envoyés par an, et ne connaît que la méthode brute pour la TVA.
L’étendue varie plus fortement que le prix. Milchbüechli et Banana sont des comptabilités au sens strict ; Magic Heidi et Pfeffersack viennent de la facturation. Rares sont les solutions qui couvrent les deux, plus la TVA et le rapprochement bancaire – et c’est précisément là que le champ se sépare.
Les fonctions comparées
| Fournisseur | Comptabilité | Factures QR | Décompte de TVA | Rapprochement bancaire | Saisie des justificatifs | Utilisateurs |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Effizo | simplifiée | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ assistée par IA | illimités |
| Milchbüechli | simplifiée | ✘ | ✘ | ✘ | manuelle | 1 |
| Simplino | simplifiée | ✔ | ✔ | – | – | – |
| Pfeffersack | type non précisé | ✔ | ✔ | – | ✔ assistée par IA | – |
| MILKEE Basic | simplifiée (partie double dès Business) | ✔ | ✘ seulement dès Business | ✔ | 120 scans par an | 2 |
| Magic Heidi Pro | type non précisé | ✔ | ✔ | ✔ CSV bancaire | ✔ assistée par IA | – |
| bexio Advanced | en partie double | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | jusqu’à 25 |
✔ signifie que le fournisseur indique lui-même la fonction. – signifie qu’elle n’est pas mentionnée sur ses pages produit et tarifs ; ce n’est pas la preuve qu’elle manque. ✘ ne figure que là où le fournisseur ne propose pas la fonction : Milchbüechli a confirmé dans sa propre FAQ qu’il ne permet ni d’établir des factures ni d’importer des fichiers d’e-banking, et ne propose pas de décompte de TVA. MILKEE indique que le décompte de TVA n’est pas inclus dans le forfait Basic. Vérifié le 19 septembre 2026, MILKEE le 28 septembre 2026.
Quelle solution pour quel cas ?
Tu veux uniquement consigner tes recettes et tes dépenses et tu rédiges de toute façon tes factures dans Word : Milchbüechli ou Banana suffisent et coûtent moins de CHF 100 par an.
Tu établis surtout des factures et comptabilises peu : Magic Heidi est conçu pour cela, avec un plan gratuit pour les trois premières factures.
Ton entreprise grandit, plusieurs personnes y travaillent, avec des stocks, des projets ou des salaires : bexio et KLARA sont faits pour cela – à des prix dès CHF 454 et CHF 576 par an respectivement.
Tu veux les deux – comptabilité et factures – sans forfaits ni coûts supplémentaires : c’est pour cela qu’Effizo a été construit. Effizo n’est pas le fournisseur le moins cher de cette liste ; avec CHF 120, il se situe dans le tiers inférieur. La différence tient à ce que ce prix unique comprend : factures avec partie paiement QR, rappels, décompte de TVA, rapprochement bancaire et saisie des justificatifs assistée par IA, sans limite du nombre d’utilisateurs et sans supplément pour l’accès de ton fiduciaire.
Effizo en bref
- CHF 120 par an – un prix fixe, sans forfaits, sans frais par utilisateur
- Comptabilité simplifiée pour les entreprises individuelles en dessous de CHF 500’000 de chiffre d’affaires
- Factures avec partie paiement QR suisse, par e-mail ou en PDF pour l’envoi postal
- Rappels en trois niveaux – tu fixes toi-même les délais et les frais de rappel
- Décompte de TVA automatique
- Rapprochement bancaire – téléverse le relevé en CAMT.053 ou en PDF, Effizo propose l’écriture correspondante
- Saisie des justificatifs assistée par IA comprise
- Nombre d’utilisateurs illimité, idéal pour l’accès de ton fiduciaire
Comparer soi-même plutôt que lire
Teste Effizo gratuitement pendant 30 jours – sans carte de crédit, sans engagement.
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Plus sur les fonctions : Comptabilité simple, Factures, Rapprochement bancaire, TVA – tous les tarifs sur la page des tarifs, la comparaison directe avec le leader du marché sur Alternative à bexio.